Svatá Anežka Česká – život a legenda, Nakladatelství Vyšehrad, Praha 2015, 4800 str., 355 obr.
Anežský klášter v Praze, druhé doplněné a rozšířené vydání, Nakladatelství Vyšehrad, Praha 2011, 463 str., 491 obr.
Klášter sv. Anežky České, průvodce, Národní galerie v Praze, Praha 1993, 56 str.
The Convent of St. Agnes of Bohemia, The National Gallery in Prague 1993, 56 p.
Anežský klášter v Praze, nakladatelství Odeon, Praha 1989, 407 str., 355 obr.
Václav Mencl, Dějiny evropské architektury II., Helena Soukupová (ed.), Národní památkový ústav a Pamiatkový úrad Slovenskej republiky, Praha 2020, 496 str., 637 obr.
Václav Mencl, Dějiny evropské architektury I., Helena Soukupová (ed.), Národní památkový ústav a Pamiatkový úrad Slovenskej republiky, Praha 2019, 208 str., 217 obr.
Program Anežčina kláštera a jeho vliv na architekturu mendikantů, in: Sztuka w kręgu krakowskich franciszkanów i klarysek, Marcin Szyma i Marek Walczak (eds.), Kraków 2020, s. 45–66.
Život v krumlovském klášteře klarisek, in: Ordo et paupertas. Krumlovský klášter minoritů a klarisek ve středověku v kontextu řádové zbožnosti, kultury a umění, Daniela Rywiková – Roman Lavička (eds.), Ostrava 2017, s. 100–128.
Osobnost zakladatelky, její život a legenda, in: Klášter sv. Anežky České, průvodce areálem, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), Národní galerie v Praze, 2016, s. 27–38;
Klášter na Františku – stručné stavební dějiny od středověku do moderní doby, in: Klášter sv. Anežky České, průvodce areálem, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), Národní galerie v Praze, 2016, s. 59–75;
Průvodce klášterem, in: Klášter sv. Anežky České, průvodce areálem, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), Národní galerie v Praze, 2016, s. 77–173;
Lapidárium Anežského kláštera, in: Klášter sv. Anežky České, průvodce areálem, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), Národní galerie v Praze, 2016, s. 175–177;
Katalog lapidária, in: Klášter sv. Anežky České, průvodce areálem, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), Národní galerie v Praze, 2016, s. 179–219.
The Founder, her Life and her Legend, in: Convent of St. Agnes of Bohemia. Monastery guide, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), National Gallery in Prague 2016, p. 27–39;
A Building History of the Na Františku Monastery, from the Middle Ages to Modern Times, in: Convent of St. Agnes of Bohemia. Monastery guide, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), National Gallery in Prague 2016, p. 59–75;
Monastery Guide, in: Convent of St. Agnes of Bohemia. Monastery guide, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), National Gallery in Prague 2016, p. 76–173;
The Lapidarium of the Convent of St. Agnes of Bohemia, in: Convent of St. Agnes of Bohemia. Monastery guide, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), National Gallery in Prague 2016, p 175–177;
Catalogue of the Lapidarium, in: Convent of St. Agnes of Bohemia. Monastery guide, Helena Dáňová – Štěpánka Chlumská (edd.), National Gallery in Prague 2016, p. 179–219.
Sdružený klášter minoritů a klarisek v Českém Krumlově a jeho místo v architektuře mendikantů, in: Klášter minoritů a klarisek v Českém Krumlově. Umění, zbožnost, architektura, Daniela Rywiková (ed.), Český Krumlov 2015, s. 31–49.
O felix lancea. K interpretaci pražského poutního odznaku a některých prvků Karlova dvorského umění, in: Setkávání. Studie o středověkém umění věnované Kláře Benešovské, Jan Chlíbec – Zoë Opačić (ed.), Artefactum / ÚDU AV ČR, Praha 2015, s. 379–404.
Kreuz Přemysl Ottokars II., in: Ludwig der Bayer, Wir sind Kaiser! Katalog des Bayerischen Landesausstellung, Regensburg 2014, N.6.14, s. 314–315.
Anežčin stavební a duchovní počin – klášter Na Františku (k 750. výročí založení královského pohřebiště), in: Svatá Anežka Česká a velké ženy její doby, in: Miroslav Šmied – František Záruba (ed.), Praha 2013, s. 135–150.
Pisánský oltář apoštola Petra v chrámu sv. Petra a Pavla na Vyšehradě, in: Královský Vyšehrad IV., Sborník příspěvků ze semináře 940 let královské kolegiátní kapituly sv. Petra a Pavla na Vyšehradě, Praha 2012, s. 166–179.
Vyšehrad v zápiscích Mořice Lüssnera, in: Královský Vyšehrad IV. Sborník příspěvků ze semináře 940 let královské kolegiátní kapituly sv. Petra a Pavla na Vyšehradě, Praha 2012, s. 284–306.
Ottokarkreuz, in: Verbündet, verfeindet, verschwärt. Bayern und Ősterreich, Herausgegeben von Wolfgang Jahn und Evamaria Brockhoff, Bayerisch-Ősterreichische Landesausstellung 2012, Band 1, s. 165–166.
Program Anežčina kláštera a jeho místo v evropské architektuře 13. a 14. století, in: Svatá Anežka Česká, princezna a řeholnice, Vladimír Kelnar – Lenka Kluková – Eva Matyášová – Lenka Rajdlová (eds.), Praha 2011, s. 10–27;
Architektonická plastika z kláštera klarisek, in: Svatá Anežka Česká, princezna a řeholnice, Vladimír Kelnar – Lenka Kluková – Eva Matyášová – Lenka Rajdlová (eds.), Praha 2011, s. 98–103;
Architektonická plastika z pohřebiště Přemyslovců ve svatyni Salvátora, in: Svatá Anežka Česká, princezna a řeholnice, Vladimír Kelnar – Lenka Kluková – Eva Matyášová – Lenka Rajdlová (eds.), Praha 2011, s. 104–115;
Náhrobní plastika, in: Svatá Anežka Česká, princezna a řeholnice, Vladimír Kelnar – Lenka Kluková – Eva Matyášová – Lenka Rajdlová (eds.), Praha 2011, s. 116–123;
Skicář Josefa Mockera, in: Svatá Anežka Česká, princezna a řeholnice, Vladimír Kelnar – Lenka Kluková – Eva Matyášová – Lenka Rajdlová (eds.), Praha 2011, s. 124–125;
Terakota a dlažba ze svatyní, in: Svatá Anežka Česká, princezna a řeholnice, Vladimír Kelnar – Lenka Kluková – Eva Matyášová – Lenka Rajdlová (eds.), Praha 2011, s. 152–154 a 158.
Náhrobky v klášteře sv. Anežky a erbovní deska diplomata a biskupa Petra Filarga (minority a od roku 1409 papeže Alexandra V.) z roku 1396, in: Epigraphica & Sepulcralia III., Sborník příspěvků ze zasedání k problematice sepulkrálních památek pořádaných Ústavem dějin umění AV ČR v letech 2009–2010, Jiří Roháček (ed.), Artefactum / ÚDU AV ČR, Praha 2011, s. 433–464.
K výkladu Oseckého lekcionáře, in: Čechy jsou plné kostelů. Bohemia plena est ecclesiis, Kniha k poctě PhDr. Anežky Merhautové, DrSc., Milada Studničková (ed.), Nakladatelství Lidové noviny, Praha 2010, s. 326–341.
Klášter klarisek v Olomouci, in: Arcidiecézní muzeum na Olomouckém hradě, Olomouc 2010, s. 167–176.
Příběh pražského kláštera cyriaků, in: Nefoťte mě před knihovnou, Kniha pro Jana Rouse, Cyril Říha (ed.), VŠUP v Praze, 2009, s. 49–67.
Pražský klášter cyriaků s kostelem sv. Kříže, in: Od knížat ke králům. Sborník u příležitosti 60. narozenin Josefa Žemličky, Nakladatelství Lidové noviny, Praha 2007, s. 254–272.
K interpretaci kostelů sv. Klimenta a sv. Vavřince, in: Královský Vyšehrad III., Sborník příspěvků ze semináře Vyšehrad a Přemyslovci (26. 9. 2006), Kostelní Vydří 2007, s. 144–159.
Klášter minoritů a klarisek v Českém Krumlově, in: Pocta Václavu Menclovi, Zborník štúdií k otázkam interpretácie stredoeuropského umenia, Dana Bořutová – Štefan Oriško (eds.), Bratislava 2000, s. 113–136.
Přemysl Otakar II. a program jeho pražského pohřebiště, in: Česko-rakouské vztahy ve 13. století. Rakousko (včetně Štýrska, Korutan a Kraňska) v projektu velké říše Přemysla Otakara II. Sborník příspěvků ze sympozia konaného 26.–27. září 1996 ve Znojmě, Marie Bláhová – Ivan Hlaváček (eds.), Praha 1998, s. 203–216 (též německy).
Bývalý klášter klarisek a minoritů u kostela sv. Františka Na Františku, in: P. Vlček – P. Sommer – D. Foltýn, Encyklopedie českých klášterů, Praha 1997, s. 508–515.
Býv. Klášter klarisek a menších bratří zv. Na Františku, in: P. Vlček a kol. Umělecké památky Prahy. Staré Město–Josefov, Praha 1996, s. 481–488.
Klášter klarisek a menších bratří v Praze na Františku, in: Blahoslavená Anežka Česká, Sborník ke svatořečení, Bohumil Svoboda (ed.), Praha, Česká katolická charita 1989, s. 51–57.
Stodesáté narozeniny Václava Mencla, in: Průzkumy památek 22, č. 1, 2015, s. 1–6.
Odkaz Václava Mencla, Zprávy památkové péče 68, 2008, s. 485–489.
Klášter sv. Anežky České po roce 1989, Zprávy památkové péče 66, 2006, s. 283–289.
K problematice Vyšehradu, Průzkumy památek 12, č. 2, 2005, s. 3–54.
Zu Datierung und Interpretation des Westportals des Zisterzienserinnenklosters Porta coeli in Tišnov (Tischnowitz), Umění 52, 2004, s. 298–309.
Cena ministra kultury za památkovou péči v roce 2004 Václavu Menclovi, Zprávy památkové péče 64, 2004, s. 449–453.
Klášter minoritů a klarisek v Českém Krumlově, Průzkumy památek 6, č. 2, 1999, s. 69–86.
Hledání ztracených míst. Klášter sv. Anežky České, Příloha časopisu T 93, s. I–VIII.
Svatá Anežka Česká v legendě a skutečnosti, Dějiny a současnost 4, 1992, s. 1992, s. 11–17.
Relikviáře z kláštera bl. Anežky v Praze na Františku, Památky a příroda 13, 1989, s. 395–400.